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牡丹SHMT基因的鉴定与生物信息学分析

2023年11月13日 09:54 周广灿,等 点击:[]

周广灿,刘夏婷,王博,杜晶晶

(菏泽学院农业与生物工程学院(牡丹学院),山东 菏泽274015)

摘要:丝氨酸羟甲基转移酶(Serine hydroxymethyltransferase,SHMT) 是一种磷酸吡哆醛(PLP)依赖酶,SHMT基因在为植物提供一碳单位和抗病虫害等方面发挥着重要作用.研究利用生物信息学方法从牡丹基因组数据库中鉴定得到33条SHMT基因.这些基因所编码的蛋白质含有69~603个不等数量的氨基酸,分子量大小为7.52~66.90 kD,理论等电点处于4.90~10.45之间,近2/3的基因都分布在第4条染色体上.启动子顺式作用原件分析显示,牡丹SHMT启动子中含有大量与植物光反应、应激反应等有关联的顺式作用原件.该研究结果可为牡丹SHMT基因功能的进一步研究奠定基础.

关键词:牡丹;SHMT基因;鉴定;演化特征

中图分类号:S685.11

文献标识码:A

文章编号:1673-2103(2023)05-0106-09

收稿日期:2023-07-22

基金项目:菏泽学院科研基金项目(XY19BS15)

作者简介:周广灿(1984—),男,山东菏泽人,副教授,博士,研究方向:植物功能基因的进化研究.


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